Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VWA8A3KMH1 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms