Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC78A2IDD5 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms