Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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SNX13Q9Y5W8 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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SNX13Q9Y5W8 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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SNX13Q9Y5W8 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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SNX13Q9Y5W8 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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SNX13Q9Y5W8 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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SNX13Q9Y5W8 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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SNX13Q9Y5W8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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SNX13Q9Y5W8 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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SNX13Q9Y5W8 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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