Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GIT1Q9Y2X7 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms