Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC8Q9Y2L5 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms