Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms