Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHORDC1Q9UHD1 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms