Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC23■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC23■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFT172Q9UG01 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms