Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms