Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DUX4Q9UBX2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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