Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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COPS7AQ9UBW8 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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COPS7AQ9UBW8 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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COPS7AQ9UBW8 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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COPS7AQ9UBW8 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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COPS7AQ9UBW8 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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COPS7AQ9UBW8 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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COPS7AQ9UBW8 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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