Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPASTQ9UBP0 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms