Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPG2Q9UBF2 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms