Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms