Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms