Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VNN3Q9NY84 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177 ms