Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXK8

FBXL12, F-box/LRR-repeat protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL12Q9NXK8 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FBXL12Q9NXK8 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FBXL12Q9NXK8 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FBXL12Q9NXK8 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FBXL12Q9NXK8 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FBXL12Q9NXK8 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FBXL12Q9NXK8 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FBXL12Q9NXK8 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FBXL12Q9NXK8 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FBXL12Q9NXK8 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FBXL12Q9NXK8 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FBXL12Q9NXK8 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FBXL12Q9NXK8 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FBXL12Q9NXK8 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FBXL12Q9NXK8 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FBXL12Q9NXK8 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FBXL12Q9NXK8 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FBXL12Q9NXK8 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FBXL12Q9NXK8 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FBXL12Q9NXK8 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FBXL12Q9NXK8 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FBXL12Q9NXK8 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FBXL12Q9NXK8 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FBXL12Q9NXK8 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FBXL12Q9NXK8 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FBXL12Q9NXK8 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FBXL12Q9NXK8 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FBXL12Q9NXK8 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
FBXL12Q9NXK8 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
FBXL12Q9NXK8 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FBXL12Q9NXK8 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms