Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOMER3Q9NSC5 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms