Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms