Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms