Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SDHAF3Q9NRP4 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SDHAF3Q9NRP4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms