Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms