Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms