Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms