Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CEP44Q9C0F1 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms