Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms