Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms