Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM4Q9C037 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms