Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP000866.2-201ENST00000504932 1493 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC01487-201ENST00000462531 905 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 SPINK1-203ENST00000510027 1188 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC011487.2-201ENST00000600193 1228 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC017002.5-201ENST00000630717 871 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 SMN1-202ENST00000380707 1536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 SMN2-203ENST00000380743 1536 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-8Q9BYQ0 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms