Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms