Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFT27Q9BW83 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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