Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV99

LRRC61, Leucine-rich repeat-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC61Q9BV99 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC61Q9BV99 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms