Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms