Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LPIN3Q9BQK8 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LPIN3Q9BQK8 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LPIN3Q9BQK8 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LPIN3Q9BQK8 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LPIN3Q9BQK8 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LPIN3Q9BQK8 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LPIN3Q9BQK8 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LPIN3Q9BQK8 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LPIN3Q9BQK8 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LPIN3Q9BQK8 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LPIN3Q9BQK8 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LPIN3Q9BQK8 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LPIN3Q9BQK8 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LPIN3Q9BQK8 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LPIN3Q9BQK8 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LPIN3Q9BQK8 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LPIN3Q9BQK8 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LPIN3Q9BQK8 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms