Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms