Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms