Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms