Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRC1Q96M27 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms