Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms