Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms