Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms