Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMPDL3AQ92484 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms