Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ04

LRTOMT, Transmembrane O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRTOMTQ8WZ04 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRTOMTQ8WZ04 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms