Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW36

ZCCHC13, Zinc finger CCHC domain-containing protein 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC13Q8WW36 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ZCCHC13Q8WW36 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms