Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms