Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MYRIPQ8NFW9 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MYRIPQ8NFW9 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MYRIPQ8NFW9 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MYRIPQ8NFW9 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MYRIPQ8NFW9 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MYRIPQ8NFW9 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MYRIPQ8NFW9 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MYRIPQ8NFW9 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MYRIPQ8NFW9 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MYRIPQ8NFW9 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MYRIPQ8NFW9 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MYRIPQ8NFW9 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms