Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDQ6

ZNF540, Zinc finger protein 540, humanhuman

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Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF540Q8NDQ6 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF540Q8NDQ6 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF540Q8NDQ6 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF540Q8NDQ6 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF540Q8NDQ6 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF540Q8NDQ6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF540Q8NDQ6 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF540Q8NDQ6 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF540Q8NDQ6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF540Q8NDQ6 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF540Q8NDQ6 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF540Q8NDQ6 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF540Q8NDQ6 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF540Q8NDQ6 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF540Q8NDQ6 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF540Q8NDQ6 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF540Q8NDQ6 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF540Q8NDQ6 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF540Q8NDQ6 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF540Q8NDQ6 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF540Q8NDQ6 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF540Q8NDQ6 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF540Q8NDQ6 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF540Q8NDQ6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF540Q8NDQ6 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF540Q8NDQ6 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF540Q8NDQ6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF540Q8NDQ6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF540Q8NDQ6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF540Q8NDQ6 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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ZNF540Q8NDQ6 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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ZNF540Q8NDQ6 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF540Q8NDQ6 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF540Q8NDQ6 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF540Q8NDQ6 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF540Q8NDQ6 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF540Q8NDQ6 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF540Q8NDQ6 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF540Q8NDQ6 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF540Q8NDQ6 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF540Q8NDQ6 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF540Q8NDQ6 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF540Q8NDQ6 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF540Q8NDQ6 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF540Q8NDQ6 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF540Q8NDQ6 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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