Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms