Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ANKRD35Q8N283 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms