Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLNKQ7Z7G1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms